programing tip

Pandas DataFrame을 사전으로 변환

itbloger 2020. 7. 12. 10:14
반응형

Pandas DataFrame을 사전으로 변환


네 개의 열이있는 DataFrame이 있습니다. 이 DataFrame을 파이썬 사전으로 변환하고 싶습니다. 첫 번째 열의 keys요소가되고 동일한 행의 다른 열의 요소가되기를 원합니다 values.

데이터 프레임 :

    ID   A   B   C
0   p    1   3   2
1   q    4   3   2
2   r    4   0   9  

출력은 다음과 같아야합니다.

사전:

{'p': [1,3,2], 'q': [4,3,2], 'r': [4,0,9]}

to_dict()메서드는 열 이름을 사전 키로 설정하므로 DataFrame의 모양을 약간 변경해야합니다. 'ID'열을 인덱스로 설정 한 다음 DataFrame을 조옮김으로써이를 달성 할 수 있습니다.

to_dict()또한 각 열의 값 목록 을 출력하는 데 필요한 '동향'인수를 허용합니다 . 그렇지 않으면 {index: value}각 열에 대해 양식 사전 이 반환됩니다.

이 단계는 다음 줄로 수행 할 수 있습니다.

>>> df.set_index('ID').T.to_dict('list')
{'p': [1, 3, 2], 'q': [4, 3, 2], 'r': [4, 0, 9]}

다른 사전 형식이 필요한 경우 가능한 방향 인수의 예는 다음과 같습니다. 다음과 같은 간단한 DataFrame을 고려하십시오.

>>> df = pd.DataFrame({'a': ['red', 'yellow', 'blue'], 'b': [0.5, 0.25, 0.125]})
>>> df
        a      b
0     red  0.500
1  yellow  0.250
2    blue  0.125

그런 다음 옵션은 다음과 같습니다.

dict- 기본값 : 열 이름은 키이고 값은 index : data 쌍의 사전입니다.

>>> df.to_dict('dict')
{'a': {0: 'red', 1: 'yellow', 2: 'blue'}, 
 'b': {0: 0.5, 1: 0.25, 2: 0.125}}

list- 키는 열 이름, 값은 열 데이터 목록

>>> df.to_dict('list')
{'a': ['red', 'yellow', 'blue'], 
 'b': [0.5, 0.25, 0.125]}

시리즈 - '목록'과 같지만 값은 시리즈

>>> df.to_dict('series')
{'a': 0       red
      1    yellow
      2      blue
      Name: a, dtype: object, 

 'b': 0    0.500
      1    0.250
      2    0.125
      Name: b, dtype: float64}

스플릿 - 값은 각각의 행 인덱스 라벨로 열 이름 데이터 값으로 되 키로 분할 열 / 데이터 / 인덱스

>>> df.to_dict('split')
{'columns': ['a', 'b'],
 'data': [['red', 0.5], ['yellow', 0.25], ['blue', 0.125]],
 'index': [0, 1, 2]}

레코드 -각 행은 키가 열 이름이고 값이 셀의 데이터 인 사전이됩니다.

>>> df.to_dict('records')
[{'a': 'red', 'b': 0.5}, 
 {'a': 'yellow', 'b': 0.25}, 
 {'a': 'blue', 'b': 0.125}]

index- 'records'와 비슷하지만 키가 색인 레이블 (목록이 아닌) 인 사전 사전

>>> df.to_dict('index')
{0: {'a': 'red', 'b': 0.5},
 1: {'a': 'yellow', 'b': 0.25},
 2: {'a': 'blue', 'b': 0.125}}

사용하려고 Zip

df = pd.read_csv("file")
d= dict([(i,[a,b,c ]) for i, a,b,c in zip(df.ID, df.A,df.B,df.C)])
print d

산출:

{'p': [1, 3, 2], 'q': [4, 3, 2], 'r': [4, 0, 9]}

Follow these steps:

Suppose your dataframe is as follows:

>>> df
   A  B  C ID
0  1  3  2  p
1  4  3  2  q
2  4  0  9  r

1. Use set_index to set ID columns as the dataframe index.

    df.set_index("ID", drop=True, inplace=True)

2. Use the orient=index parameter to have the index as dictionary keys.

    dictionary = df.to_dict(orient="index")

The results will be as follows:

    >>> dictionary
    {'q': {'A': 4, 'B': 3, 'D': 2}, 'p': {'A': 1, 'B': 3, 'D': 2}, 'r': {'A': 4, 'B': 0, 'D': 9}}

3. If you need to have each sample as a list run the following code. Determine the column order

column_order= ["A", "B", "C"] #  Determine your preferred order of columns
d = {} #  Initialize the new dictionary as an empty dictionary
for k in dictionary:
    d[k] = [dictionary[k][column_name] for column_name in column_order]

If you don't mind the dictionary values being tuples, you can use itertuples:

>>> {x[0]: x[1:] for x in df.itertuples(index=False)}
{'p': (1, 3, 2), 'q': (4, 3, 2), 'r': (4, 0, 9)}

For my use (node names with xy positions) I found @user4179775's answer to the most helpful / intuitive:

import pandas as pd

df = pd.read_csv('glycolysis_nodes_xy.tsv', sep='\t')

df.head()
    nodes    x    y
0  c00033  146  958
1  c00031  601  195
...

xy_dict_list=dict([(i,[a,b]) for i, a,b in zip(df.nodes, df.x,df.y)])

xy_dict_list
{'c00022': [483, 868],
 'c00024': [146, 868],
 ... }

xy_dict_tuples=dict([(i,(a,b)) for i, a,b in zip(df.nodes, df.x,df.y)])

xy_dict_tuples
{'c00022': (483, 868),
 'c00024': (146, 868),
 ... }

Addendum

I later returned to this issue, for other, but related, work. Here is an approach that more closely mirrors the [excellent] accepted answer.

node_df = pd.read_csv('node_prop-glycolysis_tca-from_pg.tsv', sep='\t')

node_df.head()
   node  kegg_id kegg_cid            name  wt  vis
0  22    22       c00022   pyruvate        1   1
1  24    24       c00024   acetyl-CoA      1   1
...

Convert Pandas dataframe to a [list], {dict}, {dict of {dict}}, ...

Per accepted answer:

node_df.set_index('kegg_cid').T.to_dict('list')

{'c00022': [22, 22, 'pyruvate', 1, 1],
 'c00024': [24, 24, 'acetyl-CoA', 1, 1],
 ... }

node_df.set_index('kegg_cid').T.to_dict('dict')

{'c00022': {'kegg_id': 22, 'name': 'pyruvate', 'node': 22, 'vis': 1, 'wt': 1},
 'c00024': {'kegg_id': 24, 'name': 'acetyl-CoA', 'node': 24, 'vis': 1, 'wt': 1},
 ... }

In my case, I wanted to do the same thing but with selected columns from the Pandas dataframe, so I needed to slice the columns. There are two approaches.

  1. Directly:

(see: Convert pandas to dictionary defining the columns used fo the key values)

node_df.set_index('kegg_cid')[['name', 'wt', 'vis']].T.to_dict('dict')

{'c00022': {'name': 'pyruvate', 'vis': 1, 'wt': 1},
 'c00024': {'name': 'acetyl-CoA', 'vis': 1, 'wt': 1},
 ... }
  1. "Indirectly:" first, slice the desired columns/data from the Pandas dataframe (again, two approaches),
node_df_sliced = node_df[['kegg_cid', 'name', 'wt', 'vis']]

or

node_df_sliced2 = node_df.loc[:, ['kegg_cid', 'name', 'wt', 'vis']]

that can then can be used to create a dictionary of dictionaries

node_df_sliced.set_index('kegg_cid').T.to_dict('dict')

{'c00022': {'name': 'pyruvate', 'vis': 1, 'wt': 1},
 'c00024': {'name': 'acetyl-CoA', 'vis': 1, 'wt': 1},
 ... }

DataFrame.to_dict() converts DataFrame to dictionary.

Example

>>> df = pd.DataFrame(
    {'col1': [1, 2], 'col2': [0.5, 0.75]}, index=['a', 'b'])
>>> df
   col1  col2
a     1   0.1
b     2   0.2
>>> df.to_dict()
{'col1': {'a': 1, 'b': 2}, 'col2': {'a': 0.5, 'b': 0.75}}

See this Documentation for details

참고URL : https://stackoverflow.com/questions/26716616/convert-a-pandas-dataframe-to-a-dictionary

반응형